Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfflQ6ZQM0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms