Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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Efr3bQ6ZQ18 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Efr3bQ6ZQ18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Efr3bQ6ZQ18 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Efr3bQ6ZQ18 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Efr3bQ6ZQ18 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Efr3bQ6ZQ18 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Efr3bQ6ZQ18 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Efr3bQ6ZQ18 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efr3bQ6ZQ18 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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