Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf653Q6YND2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms