Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc44a1Q6X893 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms