Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9c1Q6UJY2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms