Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms