Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccsmst1Q6RUT7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms