Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnip1Q6QD59 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms