Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms