Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms