Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf316Q6PGE4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf316Q6PGE4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms