Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup98Q6PFD9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup98Q6PFD9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms