Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtifQ6PEE2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtifQ6PEE2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtifQ6PEE2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtifQ6PEE2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtifQ6PEE2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtifQ6PEE2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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