Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85bQ6PDY0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms