Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms