Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mfsd4aQ6PDC8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mfsd4aQ6PDC8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms