Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak1Q6PD31 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms