Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms