Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tsen2Q6P7W5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsen2Q6P7W5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms