Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NesQ6P5H2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NesQ6P5H2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms