Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rrp12Q6P5B0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp12Q6P5B0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms