Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam222bQ6P539 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms