Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrimpolQ6P1E7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrimpolQ6P1E7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms