Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Soga3Q6NZL0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga3Q6NZL0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms