Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rprd2Q6NXI6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms