Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SphkapQ6NSW3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms