Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt40Q6IFX3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms