Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Smarca2Q6DIC0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Smarca2Q6DIC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms