Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk13Q69ZA1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk13Q69ZA1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms