Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spty2d1Q68FG3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms