Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms