Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf4Q64287 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf4Q64287 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms