Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms