Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc18Q640L5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ccdc18Q640L5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
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