Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vil1Q62468 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vil1Q62468 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms