Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms