Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ss18Q62280 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ss18Q62280 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ss18Q62280 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ss18Q62280 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ss18Q62280 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ss18Q62280 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ss18Q62280 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ss18Q62280 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ss18Q62280 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ss18Q62280 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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