Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn1Q62261 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms