Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms