Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms