Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prm3Q62100 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms