Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AtrxQ61687 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrxQ61687 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms