Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms