Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a1Q61165 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms