Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prpf4bQ61136 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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