Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd3Q61060 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms