Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc1Q61056 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms