Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms