Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf3Q60765 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms