Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms